HorizonGazer
  • 首页
  • 归档
  • 分类
  • 标签
  • 友链
  • 关于
一篇基于R语言的scRNA-seq文章复现

一篇基于R语言的scRNA-seq文章复现

1 文章概述 文章标题:Comprehensive single-cell transcriptomic and proteomic analysis reveals NK cell exhaustion and unique tumor cell evolutionary trajectory in non-keratinizing nasopharyngeal carcinoma 2
2024-05-20
scRNA-seq
#R #scRNA-seq #paper-reproducing
DUT人工智能与专家系统_HW4

DUT人工智能与专家系统_HW4

1 上机要求 给定七种动物虎、金钱豹、斑马、长颈鹿、鸵鸟、企鹅、信天翁,编程实现基于产生式推理的七种动物识别专家系统。规则库如下,要求给定初始条件,能识别出是哪种动物。 12345678910111213141516规则库r1: IF 该动物有毛发 THEN 该动物是哺乳动物r2: IF 该动物有奶 THEN 该动物是哺乳动物r3: IF 该动物有羽毛 THEN 该动物是鸟r4: IF 该动物
2024-03-10
人工智能与专家系统
#HW #Python #专家系统
DUT人工智能与专家系统_HW3

DUT人工智能与专家系统_HW3

1 上机要求 任选聚类算法和决策树算法中的一种算法编程实现。 任选BP神经网络和卷积神经网络中的一种模型编程实现手写体识别 2 聚类分析算法 2.1 聚类算法实现(K-Mean) K-Mean聚类算法是一种简单的迭代型聚类算法,采用距离作为相似性指标,从而发现给定数据集中的K个类,且每个类有一个聚类中心,即质心,每个类的质心是根据类中所有值的均值得到的。 对于给定的一个包含 n
2024-03-05
人工智能与专家系统
#HW #Python #聚类分析算法 #手写体识别 #深度学习
DUT人工智能与专家系统_HW2

DUT人工智能与专家系统_HW2

1 上机要求 选择遗传算法、粒子群优化算法、蚁群算法解决旅行商问题(TSP)。要求给出最短长度和最短路径。 旅行商问题(Traveling Salesman Problem,TSP)是一种经典的组合优化问题,它涉及到在给定的一组城市之间找到最短的路径,使得每个城市都被访问一次。旅行商问题最早由爱德华·阿贝尔·哈密顿在19世纪提出,但直到20世纪才引起了人们的广泛关注。旅行商问题是一个NP难题
2024-02-20
人工智能与专家系统
#HW #Python #遗传算法 #粒子群优化算法 #蚁群算法 #旅行商问题
DUT人工智能与专家系统_HW1

DUT人工智能与专家系统_HW1

1 采用广度优先搜索(BFS)、深度优先搜索(DFS)编程求解八数码问题(初始状态允许任意),找出一种从初始状态到目标状态移动步数最少的步骤。 八数码难题是一种经典的拼图游戏,也称为九宫格问题。它的目标是将一个 3x3 的方格拼图按照指定的顺序排列。每个方格上都有一个数字,其中一个方格为空,可以与相邻的方格交换位置。例如,以下是一个八数码难题的初始状态和目标状态: 1234初始状态:
2024-02-15
人工智能与专家系统
#HW #Python #BFS #DFS #AStar算法 #α-β剪枝
From Fastq data files to Read Count Matrix

From Fastq data files to Read Count Matrix

1. 实验目的 练习从Fastq数据文件到Read Count矩阵的处理步骤:copy本实验的相关文件至工作目录,将Fastq文件进行质量控制和过滤,使用常见的质量控制工具FastQC来进行质量评估;使用适当的比对工具(如STAR)将Fastq文件的序列比对到参考基因组上,为每个序列分配基因信息;利用samtools软件对BAM文件建立索引,使用IGV软件来可视化BAM文件,并熟悉IGV软件操
2023-10-20
RNA-seq
#HW #Linux #RNA-seq #下机数据初步处理
使用MAKER进行基因组注释

使用MAKER进行基因组注释

1. 实验目的 在本实验中,我们将使用MAKER进行基因组注释,它的工作原理是将尽可能多的证据沿着基因组序列排列,然后协调所有这些信号,以确定可能的基因结构。证据可以是来自同一(或密切相关)生物体的转录物或蛋白质序列。这些序列可以来自公共数据库或来自自己的实验数据(例如RNASeq实验的转录组组装)。Maker还能够考虑到重复的元素。 Maker使用ab-initio预测器(如Augustus
2023-10-20
Genomics
#HW #Linux #Genomics #MAKER
使用GATK4获取SNP

使用GATK4获取SNP

1. 实验目的 GATK (Genome Analysis Toolkit),它是用于分析高通量测序数据的命令行工具集合,主要侧重于变体发现。本实验将使用使用GATK4获取SNP。 实验步骤为:准备参考基因组其他文件构成BWA索引,将样本ZW177与参考基因进行比对,对重复reads进行排序和标记生成.sorted.dedup.bam文件 ,IGV可视化BAM文件,在单个样本上运行GATK
2023-10-10
Genomics
#HW #Linux #Genomics #GATK4 #SNP
12

搜索

Hexo Fluid
总访问量 次 总访客数 人